全國自殺防治中心（以下簡稱本中心）乃依據「全國自殺防治中心計畫」，於行政院所核定「全國自殺防治策略行動方案」第一期之計畫執行期間（2005年9月至2008年12月），分短期、中期、長期，分階段推動各項具體方案以實踐下列計畫目標所揭櫫之宗旨：
- 實施自殺防治之先導計畫，協助衛生署建立全國性自殺防治中心。
- 建立台灣自殺防治發展之概念架構。
- 擬定台灣自殺防治之重要順序與面向，議題及策略。
- 建立以實證研究結果為基礎之自殺防治成效評估指標。
- 將自殺防治之醫療面向，落實於以病人為中心、家庭為單位、社區為基礎之整合型社區健康照護體系中。
2009年起配合行政院「建置社會安全網絡」五大政策方向，全國自殺防治中心由一期計畫中兼顧國家防治策略之擬定與評估，兼顧實際參與先導區與推廣區之防治工作角色，轉型為策略研擬、方案研發及督導評估之角色。
第二期計畫乃持續擴大辦理第一期計畫，以當代自殺防治策略之全面性、選擇性與指標性三大向度作為主軸，以促進醫療及非醫療體系之自殺防治網絡整合為手段，透過資訊分析之實證基礎為策略依據，協助衛生福利部（前衛生署）執行下列工作：
- 持續規劃及評估全國自殺防治策略之指標及成效
- 落實社區心理衛生中心自殺防治業務之轉型與輔導
- 提升自殺企圖者通報及個案管理網絡之效能
- 提升安心專線服務品質
- 提供即時性全國自殺相關統計分析自殺相關資訊之服務，以作為全國或特定地區工作推動之依據。
- 持續推動專業人員及「自殺防治守門人」之教育訓練
- 透過結合國內自殺防治相關學術研究單位，以及參與自殺防治相關國際組織，加強自殺防治實證研究之質與量，以及本土性自殺危險性評估工具發展
- 落實自殺遺族及自殺防治志工組織之建立與資源連結
- 資源及衛教手冊編訂
- 擔任中央政府自殺防治相關業務之跨部會整合平台，並為負責推動全國自殺防治工作之執行單位
2011年至2019年間，「全國自殺防治中心計畫」計劃目標承第一期及第二期「全國自殺防治策略行動方案」推行之工作，依各年度需求可主要分為以下幾大類：
- 提供自殺防治相關統計分析資料
- 辦理自殺防治之實證研究
- 強化自殺防治策略
- 教育訓練、宣導、課程、教材之規劃及執行
- 召開相關聯繫會議
- 研修、訂定自殺防治相關工作規範、評估工具及流程
- 擔任中央政府自殺防治相關業務之跨部會整合平台，為負責推動全國自殺防治工作之執行單位
- 創新工作項目及其他規劃辦理事項
2020年起，本中心依「自殺防治法」第九條第二項，由中央主管機關得委託法人、團體設國家自殺防治中心，辦理下列事項：
- 自殺防治現況調查。
- 自殺資料特性分析及自殺防治計畫建議書。
- 每年製作自殺防治成果報告。
- 輔導直轄市、縣（市）主管機關，推動因地制宜之自殺防治。
- 推廣及辦理自殺防治守門人教育訓練。
- 建置及改善自殺防治通報關懷訪視制度。
- 推動醫療機構病人自殺防治事項，進行監督及溝通輔導。
- 協助傳播媒體及網際網路平臺遵守自殺新聞報導原則，並建立自律機制。
- 其他自殺防治有關事項。
上述各款規範詳情，請見衛生福利部公佈「
自殺防治法施行細則」第九條、第十條、第十一條及第十二條。